CONSTRUÇÃO DE UMA BASE DE DADOS DE TRANSCRIPTOMA HUMANO PARA APLICAÇÕES EM RNA DE INTERFERÊNCIA PARA GENES ALTERADOS NA SÍNDROME DE RETT

INTRODUÇÃO: A utilização de RNA de interferência (RNAi) apresenta potencial para o desenvolvimento de estratégias de silenciamento gênico, porém a ocorrência de efeitos off-target constitui um dos principais desafios relacionados à especificidade dessas moléculas. A avaliação computacional desses efeitos depende da disponibilidade de um conjunto abrangente de sequências de referência, capaz de representar diferentes tipos de transcritos humanos. OBJETIVOS: Desenvolver uma base de dados integrada e abrangente de transcriptoma humano, contendo sequências de RNAs codificantes e não codificantes, com a finalidade de aprimorar o design e a validação de amplicons de RNAi com alta especificidade e menor potencial de interação off-target. MATERIAIS E MÉTODO: Inicialmente, foi realizado um levantamento de bases públicas de dados de RNA, considerando critérios como espécie, tipo de sequência, versão do genoma, disponibilidade para download e atualização. Foram avaliadas 30 bases, das quais 17 foram selecionadas para compor o banco integrado. As sequências foram organizadas e submetidas a procedimentos de filtragem para seleção de registros de Homo sapiens e padronização dos formatos. Foram contempladas as classes mRNA, lncRNA, miRNA, piRNA, tRNA, rRNA, snoRNA, snRNA e circRNA. Também foi desenvolvida uma estratégia de remoção de redundâncias por clusterização utilizando o CD-HIT, com parâmetros diferenciados de acordo com as características de cada grupo de RNA. Além disso, foi desenvolvida e documentada uma convenção padronizada para os cabeçalhos FASTA, visando garantir identificação, rastreabilidade e compatibilidade das sequências. RESULTADOS: Foram selecionadas 17 bases relevantes para a composição do banco, enquanto outras fontes foram descartadas por apresentarem dados não relacionados ao objetivo, ausência de sequências, desatualização ou indisponibilidade. As sequências provenientes das diferentes fontes foram organizadas para posterior integração, e foram estabelecidas a estratégia de deduplicação, a nomenclatura padronizada e a documentação do processo. Ademais, também foram planejados procedimentos para atualização e auditoria do banco. CONSIDERAÇÕES FINAIS: Projeto resultou no desenvolvimento da estrutura necessária para a construção de uma base integrada de transcriptoma humano voltada à avaliação de possíveis efeitos off-target em RNAi. A integração de diferentes classes de RNA e fontes públicas poderá ampliar a abrangência do conjunto de referência utilizado na validação das sequências. As etapas subsequentes deverão contemplar a execução da remoção de redundâncias, a finalização do arquivo FASTA integrado e sua incorporação ao algoritmo de validação de RNAi, permitindo avaliar sua contribuição para a identificação de potenciais sequências off-target.

PALAVRAS-CHAVE: RNA de interferência; Transcriptoma humano; Efeitos off-target; Banco de dados integrado; Bioinformática.